Muokataan sivua The Edge of Evolution (kirja)

ApoWikistä
Varoitus: Et ole kirjautunut sisään. IP-osoitteesi näkyy julkisesti kaikille, jos muokkaat. Jos kirjaudut sisään tai luot tunnuksen, muokkauksesi yhdistetään käyttäjänimeesi ja saat paremman käyttökokemuksen.

Kumoaminen voidaan suorittaa. Varmista alla olevasta vertailusta, että haluat saada aikaan tämän lopputuloksen, ja sen jälkeen julkaise alla näkyvät muutokset.

Nykyinen versio Oma tekstisi
Rivi 28: Rivi 28:




'''The Edge of Evolution: The Search for the Limits of Darwinism''' (EOE) on biokemian professori [[Michael Behe]]n kirjoittama kirja, jossa hän käsittelee [[Perinnöllisen muuntelun mekanismit|evoluutiomekanismien]] empiirisesti todettuja rajoitteita. Havainnot perustuvat malarian, HI-viruksen ja ihmisväestön mutaatioista tehtyihin havaintoihin. Koska näissä tapauksissa valintapaineet ovat erityisen mittavia sekä HI-virus- ja malarialoispopulaatiot suuria ja nopeasti mutatoituvia, tämä on luultavasti parasta käytettävissä olevaa todistusaineistoa mutaation ja luonnonvalinnan kyvystä ja myös niiden rajoista.  
Biokemian professori [[Michael Behe]] käsittelee vuonna 2007 kirjoittamassaan kirjassa ''The Edge of Evolution'' [[Perinnöllisen muuntelun mekanismit|evoluutiomekanismien]] rajoitteita mm. malarialla, HI-viruksella ja ihmisväestössä havaittujen mutaatioiden ja luonnonvalinnan pohjalta. Koska näissä tapauksissa valintapaineet ovat erityisen mittavia sekä HI-virus- ja malarialoispopulaatiot suuria ja nopeasti mutatoituvia, tämä on luultavasti parasta käytettävissä olevaa todistusaineistoa mutaation ja luonnonvalinnan kyvystä ja myös niiden rajoista.  


== Malarian antibioottiresistenssit ==
== Malarian antibioottiresistenssit ==


Kun malarialoista tutkitaan koko maailman mittakaavassa, voidaan laskea yksittäisen tietyn pistemutaation todennäköisyys kun tunnetaan populaation koko ja lisääntymisnopeus sekä keskimäärin vallitseva mutaatiotaajuus. Malarialoisen genomin jokaisessa kohdassa tapahtuu mutaatio sataan kertaan jo vuoden aikana, HI-viruksella vieläkin useammin. Mitään olennaisesti uusia temppuja nämä taudinaiheuttajat eivät (onneksi) silti ole saavuttaneet.  
Kun malarialoista tutkitaan koko maailman mittakaavassa, voidaan laskea yksittäisen tietyn pistemutaation todennäköisyys kun tunnetaan populaation koko ja lisääntymisnopeus sekä keskimäärin vallitseva mutaatiotaajuus. Malarialoisen genomin jokaisessa kohdassa tapahtuu mutaatio sataan kertaan jo vuoden aikana, HI-viruksella vieläkin useammin. Mitään olennaisesti uusia temppuja nämä taudinaiheuttajat eivät (onneksi) silti ole saavuttaneet.  
<!--
 
Myös ihmisen tunnettu mutaationopeus tarkoittaa sitä, että jokaisen sukupolven aikana jokaista genomin kohtaa muutetaan kymmeniä tai satoja kertoja, eikä mitään varsinaista kehitystä tapahdu. (Päinvastoin, sillä kuten [[http://www.intelligentdesign.fi/2006/12/31/luonnonvalinta-ei-riita-kehitysoppi-ei-toimi/ Sanford osoittaa]], haitalliset mutaatiot kertyvät hiljalleen ihmisen genomiin. Ihminen ei kehity vaan rapistuu.) -->
<!--Myös ihmisen tunnettu mutaationopeus tarkoittaa sitä, että jokaisen sukupolven aikana jokaista genomin kohtaa muutetaan kymmeniä tai satoja kertoja, eikä mitään varsinaista kehitystä tapahdu. (Päinvastoin, sillä kuten [[http://www.intelligentdesign.fi/2006/12/31/luonnonvalinta-ei-riita-kehitysoppi-ei-toimi/ Sanford osoittaa]], haitalliset mutaatiot kertyvät hiljalleen ihmisen genomiin. Ihminen ei kehity vaan rapistuu.) -->


Behen analyysi perustuu empiriaan ja todennäköisyyslaskentaan tavalla, joka avautunee parhaiten esimerkkitapausten avulla: Eräs pistemutaatio tuottaa ''P. falciparum'' -malarialoiselle resistenssin [[wp:atovakoni|atovakoni]]-lääkettä vastaan. Tämän tapahtuman todennäköisyys on 10<sup>-12</sup> (yksi jaettuna miljoonalla miljoonalla) yhdelle loiselle. [[wp:Klorokiini|Klorokiini]]-lääkkeen resistenssi taas vaatii kaksi pistemutaatiota, joiden yhteiseksi todennäköisyydeksi tulee 10<sup>-20</sup>. Malaria pystyy saavuttamaan nämä resistenssit, koska sen populaatio on niin suuri: yhden potilaan ruumiissa on noin 10<sup>12</sup> loista, ja noin miljardilla ihmisellä on malaria. Spontaani resistenssi atovakoni-lääkkeelle havaitaan noin joka kolmannella henkilöllä, kun taas klorokiini-lääkkeen vastainen resistenssi kehittyy loiselle noin yhdellä ihmisellä miljardista.
Behen analyysi perustuu empiriaan ja todennäköisyyslaskentaan tavalla, joka avautunee parhaiten esimerkkitapausten avulla: Eräs pistemutaatio tuottaa ''P. falciparum'' -malarialoiselle resistenssin [[wp:atovakoni|atovakoni]]-lääkettä vastaan. Tämän tapahtuman todennäköisyys on 10<sup>-12</sup> (yksi jaettuna miljoonalla miljoonalla) yhdelle loiselle. [[wp:Klorokiini|Klorokiini]]-lääkkeen resistenssi taas vaatii kaksi pistemutaatiota, joiden yhteiseksi todennäköisyydeksi tulee 10<sup>-20</sup>. Malaria pystyy saavuttamaan nämä resistenssit, koska sen populaatio on niin suuri: yhden potilaan ruumiissa on noin 10<sup>12</sup> loista, ja noin miljardilla ihmisellä on malaria. Spontaani resistenssi atovakoni-lääkkeelle havaitaan noin joka kolmannella henkilöllä, kun taas klorokiini-lääkkeen vastainen resistenssi kehittyy loiselle noin yhdellä ihmisellä miljardista.
Rivi 64: Rivi 64:
== Kritiikkiä ==
== Kritiikkiä ==


Darvinistisen evoluutioteorian kannattajilta löytyy joitakin vastaväitteitä, jotka eivät kuitenkaan ole tähän asti muuttaneet kirjan johtopäätöksiä. Behe on vastannut useimpiin kritiikkeihin [http://behe.uncommondescent.com/ Uncommondescent-blogissaan]:
Darvinistisen evoluutioteorian kannattajilta löytyy joitakin vastaväitteitä, jotka eivät kuitenkaan ole tähän asti muuttaneet kirjan johtopäätöksiä. Behe on vastannut useimpiin kritiikkeihin [http://behe.uncommondescent.com/ Uncommondescent-blogissaan].
 
=== Toimimattomat linkit (30.4.2017) ===
 
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/06/response-to-critics-part-1-jerry-coyne/ Response to Critics, Part 1: Jerry Coyne]
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/06/response-to-critics-part-2-sean-carroll/ Response to Critics, Part 2: Sean Carroll]
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/06/response-to-critics-part-3-michael-ruse/ Response to Critics, Part 3: Michael Ruse]
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/07/back-and-forth-with-jerry-coyne-part-1/ Back and Forth with Jerry Coyne, Part 1], [http://behe.uncommondescent.com/2007/07/back-and-forth-with-jerry-coyne-part-2/ Part 2], [http://behe.uncommondescent.com/2007/07/back-and-forth-with-jerry-coyne-part-3/ Part 3]
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/07/response-to-kenneth-r-miller/ Response to Kenneth R. Miller], [http://behe.uncommondescent.com/2007/07/response-to-ken-miller-continued/ Part 2]
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/07/response-to-richard-dawkins/ Response to Richard Dawkins]
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/08/beyond-the-edge-of-evolution-the-new-york-times-story/ Beyond the Edge of Evolution: The New York Times Story] (Vastaus Kenneth Changin juttuun koskien Joseph Thorntonin tutkimuksia)
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/10/science-e-coli-and-the-edge-of-evolution-part-1/ Science, E. coli, and the Edge of Evolution: Part 1] (Kommentti koskien Isabel Gordonin tutkimusta)
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/10/science-e-coli-and-the-edge-of-evolution-part-2/ Science, E. coli, and the Edge of Evolution: Part 2]  (Vastaus Abbie "ERV" Smithin kritiikkiin ''The Panda’s Thumb'' -sivustolla)
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/10/microbe-magazine-and-the-bacterial-flagellum-part-3/ Microbe Magazine and the Bacterial Flagellum: Part 3] (Vastaus Wongin & al. kirjoitukseen ''Microbe Magazine'' -lehdessä)
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/10/korthof-and-pseudogenes-part-4/ Korthof and Pseudogenes: Part 4] (Vastaus Gert Korthofin kritiikkiin)
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/10/back-and-forth-with-sean-carroll-in-science-2/ Back and forth with Sean Carroll in Science]
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/10/reply-to-gross/ Reply to Gross]
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/10/kenneth-r-miller-and-the-problem-of-evil-part-1/ Kenneth R. Miller and the Problem of Evil, Part 1], [http://behe.uncommondescent.com/2007/10/kenneth-r-miller-and-the-problem-of-evil-part-2/ Part 2], [http://behe.uncommondescent.com/2007/10/kenneth-r-miller-and-the-problem-of-evil-part-3/ Part 3]
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/11/trends-in-ecology-and-evolution-follows-the-trend-part-i/ Trends in Ecology and Evolution follows the trend, Part I], [http://behe.uncommondescent.com/2007/11/trends-in-ecology-and-evolution-follows-the-trend-part-ii/ Part II], [http://behe.uncommondescent.com/2007/11/trends-in-ecology-and-evolution-follows-the-trend-part-iii/ Part III]
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/11/response-to-ian-musgraves-open-letter-to-dr-michael-behe-part-1/ Response to Ian Musgrave’s “Open Letter to Dr. Michael Behe,” Part 1], [http://behe.uncommondescent.com/2007/11/response-to-ian-musgraves-open-letter-to-dr-michael-behe-part-2/ Part 2], [http://behe.uncommondescent.com/2007/11/response-to-ian-musgraves-open-letter-to-dr-michael-behe-part-3/ Part 3], [http://behe.uncommondescent.com/2007/11/response-to-ian-musgraves-open-letter-to-dr-michael-behe-part-4/ Part 4], [http://behe.uncommondescent.com/2007/11/response-to-ian-musgraves-open-letter-to-dr-michael-behe-part-5/ Part 5]
*[http://behe.uncommondescent.com/2008/05/malaria-and-mutations/ Malaria and Mutations] (Kommentti koskien ''New England Journal of Medicine'' -lehdessä julkaistua tutkimusta)
*[http://behe.uncommondescent.com/2008/06/multiple-mutations-needed-for-e-coli/ Multiple Mutations Needed for E. Coli] (Kommentti koskien Richard Lenskin tutkimusta ''PNAS''-lehdessä)
*[http://behe.uncommondescent.com/2008/06/once-more-with-feeling/ Once More With Feeling] (Vastaus Kenneth Millerin kirjassa ''Only a Theory: Evolution and the Battle for America’s Soul'' esitettyyn kritiikkiin)
*[http://behe.uncommondescent.com/2009/01/miller-vs-luskin-part-1/ Miller vs. Luskin, Part 1], [http://behe.uncommondescent.com/2009/01/miller-vs-luskin-part-2/ Part 2]
*[http://behe.uncommondescent.com/2009/02/hogs-tails-or-bacon/ Hog’s tail or bacon? Jerry Coyne in The New Republic]
*[http://behe.uncommondescent.com/2009/03/waiting-longer-for-two-mutations-part-1/ Waiting Longer for Two Mutations, Part 1], [http://behe.uncommondescent.com/2009/03/waiting-longer-for-two-mutations-part-2/ Part 2], [http://behe.uncommondescent.com/2009/03/waiting-longer-for-two-mutations-part-3/ Part 3], [http://behe.uncommondescent.com/2009/03/waiting-longer-for-two-mutations-part-4/ Part 4], [http://behe.uncommondescent.com/2009/03/waiting-longer-for-two-mutations-part-5/ Part 5] (Vastaus R. Durrettin ja D. Schmidtin ''Genetics''-lehdessä julkaistuun artikkeliin ''Waiting for Two Mutations: With Applications to Regulatory Sequence Evolution and the Limits of Darwinian Evolution'')
*[http://behe.uncommondescent.com/2009/03/%E2%80%9Cthe-old-enigma%E2%80%9D-part-1-of-3/ “The Old Enigma,” Part 1 of 3], [http://behe.uncommondescent.com/2009/04/%E2%80%9Cthe-old-enigma%E2%80%9D-part-2-of-3/ Part 2 of 3], [http://behe.uncommondescent.com/2009/04/%E2%80%9Cthe-old-enigma%E2%80%9D-part-3-of-3/ Part 3 of 3] (Kommentti D. J. Whiteheadin & al. artikkelista ''The look-ahead effect of phenotypic mutations'')
*[http://behe.uncommondescent.com/2009/05/letter-to-science/ Letter to Science] (Vastaus John Travisin artikkeliin ''Science''-lehdessä)
*[http://behe.uncommondescent.com/2009/05/letter-to-trends-in-microbiology/ Letter to Trends in Microbiology] (Vastaus L. A. S. Snyderin & al. artikkeliin ''Trends in Microbiology'' -lehdessä)
*[http://behe.uncommondescent.com/2009/09/reducible-complexity-in-pnas/ “Reducible complexity” in PNAS] (Vastaus A. Clementsin & al. artikkeliin ''Proceedings of the National Academy of Sciences'' -lehdessä)
*[http://behe.uncommondescent.com/2009/09/nature-publishes-paper-on-the-edge-of-evolution-part-1/ Nature publishes paper on the edge of evolution, Part 1], [http://behe.uncommondescent.com/2009/10/nature-publishes-paper-on-the-edge-of-evolution-part-2/ Part 2], [http://behe.uncommondescent.com/2009/10/nature-publishes-paper-on-the-edge-of-evolution-part-3/ Part 3] (Kommentti Joseph Thorntonin tutkimuksista, jotka tukevat kirjassa esitettyä argumenttia)
*[http://behe.uncommondescent.com/2009/10/new-work-by-richard-lenski/ New work by Richard Lenski]
*[http://behe.uncommondescent.com/2009/10/response-to-carl-zimmer-and-joseph-thornton-part-1/ Response to Carl Zimmer and Joseph Thornton, Part 1], [http://behe.uncommondescent.com/2009/10/response-to-carl-zimmer-and-joseph-thornton-part-2/ Part 2], [http://behe.uncommondescent.com/2009/10/response-to-carl-zimmer-and-joseph-thornton-part-3/ Part 3], [http://behe.uncommondescent.com/2009/10/response-to-carl-zimmer-and-joseph-thornton-part-4/ Part 4]
*[http://behe.uncommondescent.com/2010/02/misusing-protistan-examples-to-propagate-myths-about-intelligent-design/ Misusing Protistan Examples to Propagate Myths about Intelligent Design] (Vastaus ''International Society of Protistologists'' -työryhmän ''Journal of Eukaryotic Microbiology'' -lehdessä julkaisemaan kritiikkiin)
*[http://behe.uncommondescent.com/2010/03/a-malodorous-argument-for-darwinian-evolution/ A malodorous argument for Darwinian evolution] (Kommentti John Avisen kirjasta ''Inside the Human Genome: A Case for Non-Intelligent Design'')


=== P. Z. Myers ja Lenskin tutkimukset ===
=== P. Z. Myers ja Lenskin tutkimukset ===


[[Suunnitteluteoria]]a kritisoiva P. Z. Myers on kritisoinut Behen kirjoituksia blogitekstissään<ref name="Myers200806">{{cite web |url=http://scienceblogs.com/pharyngula/2008/06/10/historical-contingency-in-the/ |title=Historical contingency in the evolution of E. coli | author = P.Z.Myers | date =  2008-06-10 |format= |work= |accessdate=2017-04-30}}</ref> liittyen L. E. Lenskin kuuluisiin bakteerikokeisiin. Kokeissa on kasvatettu bakteereita laboratoriossa 20 vuotta niin että populaatiosta on pakastettu osa talteen tietyin väliajoin. Suurin piirtein 31500 sukupolven kohdalla eräällä bakteeripopulaatiolla ilmeni uusi ominaisuus, jonka avulla ne kykenivät käyttämään hapellisissa olosuhteissa sitraattia ravinnonlähteenään. Jos tämän ominaisuuden saamiseksi olisi riittänyt yksi mutaatio, se olisi esiintynyt paljon nopeammin ja useammin. Kyseessä ei kuitenkaan ollut kahden mutaation yhtäaikainen yhdistelmä, sillä kävi ilmi, että kyseisen populaation kantamuodot kykenivät 20000 sukupolven kohdalla saamaan kyseisen mutaation helpommin kuin tätä ennen. Kyseessä oli siis neutraali välivaihe. Lisäksi populaatiossa tapahtui kolmas mutaatio 33000 sukupolven kohdilla, joka tehosti sitraatin käyttöä.
[[Suunnitteluteoria]]a kritisoiva P. Z. Myers on kritisoinut Behen kirjoituksia blogitekstissään<ref name="Myers200806">{{cite web |url=http://scienceblogs.com/pharyngula/2008/06/historical_contingency_in_the.php |title=Historical contingency in the evolution of E. coli | author = P.Z.Myers | date =  2008-06-10 |format= |work= |accessdate=2010-05-03}}</ref> liittyen L. E. Lenskin kuuluisiin bakteerikokeisiin. Kokeissa on kasvatettu bakteereita laboratoriossa 20 vuotta niin että populaatiosta on pakastettu osa talteen tietyin väliajoin. Suurin piirtein 31500 sukupolven kohdalla eräällä bakteeripopulaatiolla ilmeni uusi ominaisuus, jonka avulla ne kykenivät käyttämään hapellisissa olosuhteissa sitraattia ravinnonlähteenään. Jos tämän ominaisuuden saamiseksi olisi riittänyt yksi mutaatio, se olisi esiintynyt paljon nopeammin ja useammin. Kyseessä ei kuitenkaan ollut kahden mutaation yhtäaikainen yhdistelmä, sillä kävi ilmi, että kyseisen populaation kantamuodot kykenivät 20000 sukupolven kohdalla saamaan kyseisen mutaation helpommin kuin tätä ennen. Kyseessä oli siis neutraali välivaihe. Lisäksi populaatiossa tapahtui kolmas mutaatio 33000 sukupolven kohdilla, joka tehosti sitraatin käyttöä.


Myersin kritisoi Beheä Lenskin tutkimusten vääristelystä ja väärinymmärryksistä. Myersin argumentaatio ei kuitenkaan tunnu olevan täysin vedenpitävää.
Myersin kritisoi Beheä Lenskin tutkimusten vääristelystä ja väärinymmärryksistä. Myersin argumentaatio ei kuitenkaan tunnu olevan täysin vedenpitävää.
Rivi 118: Rivi 84:
* [[Evoluutioteoria]]
* [[Evoluutioteoria]]
* [[Suunnitteluteoria]]
* [[Suunnitteluteoria]]
* [[Maailman hienoin esitys (kirja)]]
{{Evoluutio}}


=== Internet ===
=== Internet ===
==== Videot & audiot ====
*[http://www.amazon.com/gp/blog/A3DGRQ0IO7KYQ2/ref=cm_blog_blog Behen Amazon-blogi], jossa hän saa tarpeeksi palstatilaa vastata kriitikoilleen.
*[http://www.c-spanvideo.org/program/199326-1 Behe luennoi kirjastaan (13.06.2007)], video (1h 33min)
*[http://creation.com/review-michael-behe-edge-of-evolution Journal of Creation: [[AW:S#äskettäisluomisnäkemys|äskettäisluomisnäkemystä]] edustavan Don Battenin arvio kirjasta]
*[http://bloggingheads.tv/diavlogs/22075 Blogginheads.tv: Irreducibly complex edition], Behe keskustelee John McWhorterin kanssa (Video, 44min)
*[http://www.dailymotion.com/video/x100goo_michael-behe-on-the-colbert-report_news Behen haastattelu The Colbert Report -ohjelmassa], (video, 5min)
*[http://www.pointofinquiry.org/michael_behe_the_edge_of_evolution/ Point of Inquiry -haastattelu] (mp3-audio)
 
==== Tekstit ====
===== Toimivat linkit (30.4.2017) =====
*[http://creation.com/review-michael-behe-edge-of-evolution Journal of Creation]: [[AW:S#äskettäisluomisnäkemys|äskettäisluomisnäkemystä]] edustavan Don Battenin arvio kirjasta
===== Toimimattomat linkit (30.4.2017) =====
<!--*[http://www.amazon.com/gp/blog/A3DGRQ0IO7KYQ2/ref=cm_blog_blog Behen Amazon-blogi], jossa hän saa tarpeeksi palstatilaa vastata kriitikoilleen.-->
*[http://behe.uncommondescent.com/2007/06/questions-about-my-new-book/ Questions about my new book?] Behen haastattelu kirjasta
*[http://behe.uncommondescent.com/2009/09/nature-publishes-paper-on-the-edge-of-evolution-part-1/ Nature-lehdessä 2009 julkaistun artikkelin tulokset vahvistavat Behen argumenttia].
*[http://behe.uncommondescent.com/2009/09/nature-publishes-paper-on-the-edge-of-evolution-part-1/ Nature-lehdessä 2009 julkaistun artikkelin tulokset vahvistavat Behen argumenttia].


== Viitteet ==
== Viitteet ==
{{Viitteet|sarakkeet}}
{{Viitteet}}


[[Luokka:Kirjat]][[Luokka:Suunnitteluteoria]][[Luokka:Evoluutioteoria]]
[[Luokka:Kirjat]][[Luokka:Suunnitteluteoria]][[Luokka:Evoluutioteoria]]
Muutoksesi astuvat voimaan välittömästi. Kaikki ApoWikiin tehtävät tuotokset katsotaan julkaistuksi GNU Free Documentation License 1.3 or later -lisenssin mukaisesti (ApoWiki:Tekijänoikeudet). Jos et halua, että kirjoitustasi muokataan armottomasti ja uudelleenkäytetään vapaasti, älä tallenna kirjoitustasi. Tallentamalla muutoksesi lupaat, että kirjoitit tekstisi itse, tai kopioit sen jostain vapaasta lähteestä. ÄLÄ KÄYTÄ TEKIJÄNOIKEUDEN ALAISTA MATERIAALIA ILMAN LUPAA!
Peruuta Muokkausohjeet (avautuu uuteen ikkunaan)